Морская полиция: Спецотдел, 5-й сезон

Старшина, как полагают, погиб в автокатастрофе, пока несоответствия на месте преступления не показывают, что старшина был убит, а не был водителем разбитого автомобиля. Когда водитель автомобиля позже найден, Даки проводит вскрытие и обнаруживает, что жертва была избита до смерти и родила не за долго до этого. Это принуждает команду считать, что убийца взял ее ребенка.

Две женщины находят военно-морского Капитана мертвым на Военной базе. Одна из них является его женой, а другая — третьей бывшей женой Гиббса. Поскольку Специальный агент Гиббс и лейтенант Колонель Манн проводят совместное расследование убийства, агент DIA направляется, чтобы контролировать то, как Эбби обрабатывает ноутбук Капитана, который содержит очень секретные данные. Гиббсу становится неуютно, когда он вынужден быть между своей бывшей женой, Полковником Манн, и Директором Шепард.

Даки возмущен, что одно из исследований его трупов показало, что жертва была по ошибке помечена как «Джон Доу» и пожертвована науке. Труп идентифицирован командой как профессиональный уголовник, который работал с ФБР, чтобы разыскать человека, подозреваемого в поставке людей с новыми личностями. NCIS работает с ФБР, чтобы захватить его и найти убийцу.

Когда Лейтенант Флота, который работал в Пентагоне офицером разведки, пытается совершить самоубийство, спрыгнув с крыши, NCIS вызывается, чтобы консультироваться с офицером. После того, как Гиббс в убеждает офицера отойти от края, офицера застреливают. У каждого члена команды Гиббса есть различная теория убийства, одна из которых включает что офицер является «кротом».

Команду Гиббса посылают, чтобы исследовать смерть на борту химеры USNS, сверхсекретное военно-морское исследовательское судно, проплывающее в середине океана.

Эпизод начинается с Тони, который извлекает Гиббса из воды и пытается вернуть его к жизни. Показано, что Мэдди, подруга детства умершей дочери Гиббса Келли, приезжает к нему за помощью, что в последствии приводит к событиям, в которых автомобиль Гиббса падает в воду.

Гиббс и его команда расследуют убийство морского Адмирала и встречают женщину, поиск мужа которой, политического беженца из Африки, связан с их расследованием.

В то время как группа бойскаутов находится в NCIS, Абби говорит команде искать отца похищенного мальчика в 1998 году.

Команда NCIS платит высокую цену, когда они пытаются разыскать Морского пехотинца, который как полагают, находится все еще в Ираке. Помощник Сенатора начинает вмешиваться в расследование.

Команда NCIS занимается расследованием, когда мусульманский Морской пехотинец найден мертвым около мечети, которая подозревается ФБР в вербовке террористов. Их поиск отсрочен, когда Даки отказывается провести вскрытие Морского пехотинца из уважения к религиозным верованиям семьи Морского пехотинца.

Когда военно-морской радар на основе высоких технологий пропадает, но найден снова, команда решает поймать вора — использовать радар как приманку.

Эбби пытается доказать невиность собаки, которую преследует команда NCIS во время операции захвата наркодилера.

Команда собирается в доме Гиббса, и занимается расследованием, чтобы подтвердить, что он был действительно убит.

Когда Морской Капитан убит во время минометного обстрела, оказывается, что его застрелили. Тони и Никки Жардин посылают в Багдад, чтобы заняться расследованием, а в это время остальная часть команды помогает, занимаясь расследованием в США.

Зива тайно работает, чтобы найти убийцу, который убил пять женщин и отрезал их пальцы после того, как они умерли.

Расследуя смерть человека на стройплощадке, Джимми Палмер следует за подозрительным человеком, который шпионит вокруг, но человек стрелляет в него. Оставленный контуженным, Джимми изо всех сил пытается запомнить лицо человека и таким образом идентифицировать его. В конце команда находит его, но стрелок пытается сбежать, но Джимми удается остановить его в его автомобиле.

Двое мальчишек балуются с духовой винтовкой, стреляют в почтовый ящик, а потом решают продырявить надувной матрас, на котором лежит уснувший мужчина. Они стреляют, матрас идет ко дну, но человек на нем так и не шевелится, поскольку к этому моменту он уже некоторое время мертв. Этим человеком оказывается агент Уильям Декер, и Зива с Тони сопровождают Дженни на его похороны. Расписываясь в книге, Дженни слышит упоминание о некоем мистере Ошимайде, идет за говорящими и незаметно фотографирует камерой в телефоне.