Действие фильма разворачивается в 1975 году в Испании. Диктатор Франсиско Франко, управлявший Испанией более тридцати лет, отошел от дел и скрылся от чужих глаз в своей загородной резиденции Эль-Пардо. В окружении Франко лишь близкие родственники и несколько верных солдат. Диктатор изводит своих приближенных капризами и безумными идеями, поэтому родственники решают пригласить в резиденцию врача. Их выбор падает на доктора Мюллер, которая практикует альтернативную медицину. «Прощай, Генералиссимус!» — сатирическая комедия об испанском диктаторе Франко.