Знахарь, 1-й сезон. Знахарь

За решеткой Разин не забывает о клятве Гиппократа и спасает жизнь одному из офицеров охраны, за что начальник тюрьмы Картаев предлагает ему возглавить лазарет. Знахарь отказывается и продолжает лечить заключенных «неофициально», постепенно заслуживая их уважение. Однажды к нему за помощью обращается Картаев с просьбой вылечить его племянницу Кристину от наркозависимости. Врач берется за дело и, посещая дом начальника, входит к нему в доверие. Пожалуй, лучшего шанса сбежать уже не будет, и Знахарь использует эту возможность, прихватив с собой Блондина.

Картаев требует, чтобы Знахарь продолжил лечить Кристину и после неудавшегося побега. Она же тайком от дяди похищает ключ и помогает пленнику сбежать через реку на лодке. А в это время в тюрьме происходит ЧП: на свободу вырываются трое заключенных. Картаев бросается в погоню, но тщетно: беглецы уже скрылись в тайге… Знахарь встречается с проводником Комяком, и вместе они спешат скрыться в лесу.

Знахарь и Комяк пробираются сквозь лес и болота. Простудившись, Константин тяжело заболевает и не может идти дальше. Тогда спутник доводит его до тайника с одеждой, едой и лекарствами, а сам отправляется за помощью в деревню старообрядцев. Старейшина — отец Евстрат — соглашается помочь, и Комяк везет Знахаря в деревню. Матушка Меланья лечит Знахаря, а помогает ей молодая девушка Настя. Тем временем Чечев докладывает Картаеву о безуспешных поисках беглецов, но начальник тюрьмы считает, что отступать рано, и направляет отряд в селение старообрядцев.

Настя ухаживает за Знахарем, и он выздоравливает. Между ними вспыхивает сильное чувство. Отец Евстрат и брат Насти Алексей замечают это и предлагают Константину остаться с ними, приняв их веру. Но он отказывается, так как прекрасно понимает, что нужно во что бы то ни стало продолжать путь. Подполковник Согришин и Чечев обыскивают деревню староверов, но Настя успевает спрятать беглеца, и отряд уходит ни с чем. Егорша, Косяк и Лиса убивают троих солдат охраны и забирают их оружие. Чечев докладывает о случившемся Картаеву, но тот убежден, что Знахарь не имеет к этому убийству никакого отношения.

Беглые заключенные нападают на Знахаря и его спутников. В перестрелке они убивают Трофима, ранят Комяка и Настю. Константин в ярости расстреливает преступников, а в это время путников догоняют старообрядцы во главе с Игнатием. Они забирают Настю в деревню, а Комяк доводит Знахаря до поселка и передает людям Араба, которые доставляют его в Пермь. Там беглецу делают пластическую операцию и выдают документы на имя Дениса Сельцова.

Знахарь подстраивает свое случайное знакомство с Ангелиной, представляясь ей Денисом Сельцовым. Арцыбашев организует арест Стилета и изъятие воровского «общака» и предлагает ему выдать Знахаря в обмен на возврат «общака». Узнав о том, что ее муж на свободе, Ангелина впадает в панику и просит Леонида о помощи. Люди Хопина прячут Ангелину и Леонида в своем доме, но Знахарь, Конфетка и Миха Ворсистый выслеживают их. 

Знахарь встречается с Ангелиной и признается ей в том, что он — Разин. Под давлением Знахаря Леонид соглашается убить Хопина. Он приезжает к Хопину и подсыпает ему яд в кофе. Хопин умирает, а Леонида арестовывают и сажают в СИЗО. Знахарь, понимает, что его ищут, и знакомится с соседкой по своей даче Наташей, которая предлагает ему пожить в ее доме. Выясняется, что отец Наташи — Арцыбашев.

Арцыбашев и Наташа угрожают Знахарю и требуют выполнить их задание — найти Студня в зоне, где раньше сидел сам Знахарь. Знахаря отправляют в зону, где он ранее сидел. Наташа узнает от матери Студня, что отец Студня передал своей семье кольцо с шифром, по которому Студень должен был получить у Тохтамбаш-баши наследство. Арцыбашев вспоминает, как в Афганистане, как в Афганистане убил Студенного, узнав об условиях передачи клада его сыну. Знахарь встречается с новым смотрящим своей зоны Железным и узнает подробности о кольце. Арцыбашев настаивает на продолжении поисков Студня с помощью старообрядцев. В деревне старообрядцев Евстрат рассказывает Знахарю, что Меланья вылечила Студня, забрав у него кольцо. Настя возвращает кольцо Знахарю. Знахарь женится на Насте, и вместе они возвращаются в Петербург. 

По приказу Арцыбашева Знахарь и Настя отправляются в Душанбе на встречу с Тохтамаш-баши, чтобы забрать у него кольцо Студенного. Но Кемаль похищает Настю и требует за ее жизнь кольцо Тохтамаш-баши. На встречу с Тохтамбаш-баши Знахарь берет с собой Наташу. Однако настоящий Студень уже в плену у Тохтамаш-баши. Студень и Знахарь вступают в поединок за кольцо и наследство Студеного. По пути назад на Наташу и Знахаря нападают бандиты, но им удается спастись. Наташа предлагает Знахарю устроить встречу Кемаля и Арцыбашева. Во время их встречи в перестрелке погибают Настя, Кемаль, Арцыбашев и их люди. Знахарь забирает у Кемаля третье кольцо и объединяет его вместе с первыми двумя. Теперь он знает номер счета и название банка, написанные на кольцах и забирает из банка ларец с драгоценными камнями. На полученные средства Знахарь открывает наркологическую клинику. Глава террористов Надир-шах и генерал ФСБ Губанов начинают поиски Знахаря.

Стилет вымогает у Знахаря деньги, но Знахарь объявлен в международный розыск, и ему не удается получить деньги в банке, где хранятся драгоценные камни. Знахарь пытается снять деньги в итальянском банке, но его задерживает полиция и передает сотрудникам ФСБ Шапошникову и Наташе, которые хотят помочь ему. Люди Губанова продолжают следить за Знахарем в Италии. Люди Надир-шаха нападают на квартиру, в которой прячется Знахарь, но Наташе и Знахарю удается всех убить и скрыться, устроив пожар. Один за другим гибнут друзья Знахаря — Миха Ворсистый, Слава-Крокодил и Железный... ФСБ привозит обгоревшие трупы в Москву, но экспертиза показывает, что Наташи и Знахаря среди них нет. Однако Губанов устраивает фальшивые похороны Знахаря и Наташи и планирует выманить Знахаря из укрытия с помощью брата Насти Алексея. ФСБ похищает его. С помощью Наташи Знахарь возвращается в Петербург и скрывается. 

Стилет узнает о гибели Знахаря, но Знахарь не хочет больше скрываться и назначает встречу Стилету. Генерал Губанов внушает Алексею, что Знахарь — опасный преступник и именно он виновен в смерти Насти. Завербованного Алексея тренируют на учебной базе ФСБ. Знахарь отдает Стилету деньги, а Стилет организует коронацию Знахаря «вором в законе». Воры требуют от Знахаря распространять их наркотики через его клинику и получают согласие. Но Знахарь изготавливает из партии наркотиков Стилета лекарства и лечит ими наркоманов в своей клинике. Алексей находит Знахаря и совершает попытку его убить, вопреки заданию Губунова. В результате Знахарь теряет один глаз. ФСБ теряет из виду Алексея и Знахаря, которые скрываются. Наташа встречается с Губановым и соглашается помочь ему в поимке Знахаря взамен на свою свободу. Знахарь собирает компромат на Стилета и других воров и оплачивает обучение Кристины Картаевой во Франции. Алексей узнает от Знахаря правду о смерти Насти, и они вместе едут на ее могилу в Душанбе.

Наташа прилетает к Знахарю в Душанбе и признается в том, что работает на ФСБ и Губанова, который поручил ей найти деньги Знахаря. Но она утверждает, что хочет помочь ему. Надир-шах похищает Алексея и требует Знахаря вернуть драгоценные камни. Алексей узнает древнюю священную книгу в доме, где его держат люди Надир-шаха и рассказывает им, что видел такую же у себя в деревне старообрядцев. Наташа просит Губанова помочь Знахарю спасти Алешу. Губанов согласен, а Знахарь думает, как сохранить камни и спасти Алексея. В Казань приезжает человек Надир-шаха Ахмад и привозит первый экземпляр священной книги. Надир-шах привозит Алексея в Казань. Знахарь угрожает Стилету разоблачением на сходняке воров. 

ФСБ устанавливает «прослушку» в ресторане, где должен состояться «сходняк». Наташа показывает Знахарю их новые документы, по которым они в качестве мужа и жены должны выехать в Египет за Алексеем. На сходняке Знахарь угрожает ворам, изобличая их в глазах друг друга. Но Саша Сухумский требует от него отступных денег за право выйти из воровского мира. Знахарь уезжает. Наташа подслушивает план воров устранить Знахаря, посадив его в тюрьму. В тюрьме Знахарь знакомиться с Гансом, который предупреждает его о том, что сходняк хочет убить его и получает от Наташи записку с инструкциями о побеге. Знахарю удается сбежать. Переводчик книги показывает Надир-шаху место недалеко от Казани, где возможно находятся сокровища. Теперь Надир-шаху нужен второй экземпляр книги. Знахарь и Наташа едут в Египет и договариваются о встрече с людьми Надир-шаха.

Человек Надир-шаха Садик встречается со Знахарем и забирает у него оставшиеся драгоценные камни. Но Надир-шах выдвигает новые условия обмена — камни остаются у Знахаря, а теперь Надир-шаху нужен второй экземпляр священной книги. Знахарь отправляется в деревню староверов и забирает книгу у Евстрата. Знахарь встречается с человеком Надир-шаха в Казани, а Наташа и сотрудники охраны Знахаря — Петр Валеев и Рамиль следят за процессом переговоров. В момент передачи книги появляется группа захвата ФСБ и Губанов. В перестрелке погибают люди Надир-шаха, а Алексея снова увозят. Но книга остается у Знахаря, и вместе с Наташей он разрабатывает новый план спасения Алексея. Родственник Рамиля мулла переводит страницу из книги, где описано местонахождение сокровищ Золотой Орды. Теперь об этом знают только мулла и Знахарь. Знахарь решает поехать в Пакистан с Наташей и охранниками без книги, чтобы спасти Алексея.