Атаман, 1-й сезон

Появление в станице Юрия Воронина очень сильно озадачило не только местных бандитов, но и заместителя начальника милиции Чичагова.
Неудачные попытки Шнырева либо привлечь Воронина на свою сторону, либо заставить уехать из станицы ни к чему не привели.
Начальник станичной милиции Титов, с которым Воронин поделился своими сомнениями по поводу появления в станице коммерсантов с Кавказа, тоже начал подозревать Чичагова в нечистоплотности.
Сопоставив некоторые факты, Титов обвиняет Чичагова в сговоре с бандитами. Понимая, что Титов может сорвать тщательно подготовленную операцию, Чичагов убивает его, инсценировав самоубийство.

Алексею Шныреву повезло. Он чудом остался в живых после провала операции с оружием и смог бежать из станицы в Тиходонск.
В станице назначили нового начальника милиции, некого Точилкина.
Приступив к работе, он первым делом обвиняет сына Полины, Тихона, в краже. Воронин, дед Прохор, Полина и глава станичной администрации Кудинов, понимая, что обвинение несправедливо, пытаются как-то выручить Тихона.

Начальник станичной милиции Точилкин уверен в том, что Тихону помогли бежать. Он готов обвинить в этом всех станичников и прежде всего Воронина. Юрий, Демидов и дед Прохор снова едут в город, чтобы встретиться с адвокатом.
А тем временем в Тиходонске Шнырев разрабатывает новую операцию. Чтобы снять с себя вину перед боевиками за провал операции и потерю денег и оружия, Ремнев разрабатывает хитроумный план — ограбление собственного банка. Эту операцию и должен провести Шнырев. Все продумано до мелочей, ничто не должно помешать осуществлению их плана.

К дальней родственнице в станицу из Америки приехал погостить Майкл Котошихин, потомок казаков-эмигрантов.
Майкл увлечен изучением истории казачества и традициями казаков, а станичники, особенно, Катерина, Тихон и дети Полины, помогают ему в этом.
Дед Прохор, наконец-то найдя благодарного слушателя, с удовольствием агитирует Майкла освоить верховую езду и джигитовку под руководством Демидова. Но придя в конюшню, наши герои обнаруживают, что самый лучший, «бриллиантовый», жеребенок похищен.

Юрий, уходя из аула через горы, неожиданно срывается в пропасть.
В пустынных горах помощи ждать неоткуда, гибель кажется неизбежной. Однако ему на помощь приходит старший лейтенант пограничных войск Барминцев по прозвищу Снежный человек.
Барминцев приводит Юрия в свое убежище, которое кажется Юрию сказочной пещерой Али-бабы, так много тут всякого конфискованного у нарушителей добра. Среди прочего обнаруживается и полевая рация, с помощью которой Барминцеву удается отслеживать пути контрабандистов, и мобильный телефон.

Воронин сообщает полковнику Дубровцеву о документах, переданных ему Русланом Мовсадовым.
Дубровцев говорит Юрию, что часть документов прочитать невозможно, и просит Воронина приехать в Москву.
Командиры Абдуллы, разъяренные провалом операции с оружием и потерей огромных денег, приказывают ему провести показательную акцию — захватить станицу Орликовскую и предъявить властям ультиматум.
Ранним утром в станицу въезжают несколько автобусов с боевиками.

Майкл и Тихон, которым очень хочется помочь Воронину, тайком выбираются из крепости, но сразу же попадают в руки боевиков. Привязав избитых мальчишек к крестам, боевики выставляют их перед воротами крепости.
Абдулла продолжает уговаривать казаков сложить оружие, угрожая убить Майкла и Тихона. Трусливый Точилкин пытается убедить казаков «с честью» сдаться на милость боевиков, но его никто не слушает.

Полковник Дубровцев приезжает к Воронину в госпиталь и просит узнать, каким образом автобусы с боевиками и оружием смогли попасть в станицу. Для этого Юрий под видом контрактника должен внедриться в подразделение капитана Негретова.
Воронин очень хочет побыстрей вернуться в станицу — там осталось много незавершенных дел, но Дубровцеву удается уговорить его остаться.
Навестить друга приезжают станичники: Демидов, дед Прохор, Майкл и Тихон. Соскучившийся по дому Воронин отпрашивается из госпиталя домой.

Негретов отправляет Воронина с пакетом к зеленодольскому военному прокурору Трошкину, также причастному к махинациям. Подойдя к двери дома прокурора, Юрий слышит обрывок телефонного разговора жены Трошкина Зои. Знакомое прозвище «Комсомолец» заставляет его насторожиться.
Итак, в Тиходонск к Ремневу, представившись работником «Плодоовощимпорта», приезжает Ибрагим-али, бывший комсомольский работник, а ныне известный полевой командир, находящийся в розыске.

Ремневу удается, не привлекая к себе внимания, исчезнуть из поля зрения команды полковника Дубровцева и своих «компаньонов». Теперь ни одна живая душа не знает, где его искать.
Полковник Дубровцев с помощью Воронина и той информации, которую удалось добыть Юрию, пытается установить местонахождение Ремнева, поскольку без него распутать этот страшный клубок не удастся.

Полковник Дубровцев, понимая, что перепуганный Ремнев не поверит никому, кроме Воронина, отправляет Юрия на Кипр. Он должен уговорить банкира вернуться в Россию.
В Москве, в Измайловском парке, встречаются два бывших комсомольских работника. Один — полевой командир Ибрагим-али, другой — Игорь Володин, ныне ответственный работник «Росвооружения». Им необходимо убрать Ремнева, поскольку они понимают, что группа полковника Дубровцева через него легко выйдет на их след.

В Москве Воронина и Ремнева встречают люди из группы полковника Дубровцева, но по пути из аэропорта на их машину совершается нападение. В живых остается только Воронин. Ему удается скрыться с места происшествия и добраться до старого друга Владимира Михеева по прозвищу Михей. Михей — бывший воин-афганец, ставший теперь вором «в законе».
Узнав о том, что произошло с его другом, Михей подозревает в предательстве полковника Дубровцева. Воронин отказывается в это верить.

Михей прячет Воронина на квартире в Москве, а сам, решив помочь другу, начинает собственное расследование.
Тем временем в Тиходонске казаки осаждают здание областной администрации, требуя восстановить доброе имя своего земляка. Они хотят знать, почему Воронина, о котором еще недавно писали газеты как о герое, объявили в розыск.

Благодаря полковнику Дубровцеву восстановлено доброе имя Воронина. Он вновь в строю.
Дубровцев просит Юрия войти в свою группу и помочь найти тайную черную тетрадь Ремнева. Упоминания о ней были найдены в бумагах банкира.
Дубровцев очень надеется, что информация, содержащаяся в тетради, поможет раскрыть это сложное и запутанное дело.